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借助等离激元天线增强红外光谱揭示DNA与非天然碱基的氢键相互作用

Li, J., Li, J., Yan, Z., Ding, XL., Xia, XH.,
The journal of physical chemistry letters

Abstract

在DNA编程中引入非天然碱基可突破沃森-克里克和霍格steen碱基配对的限制,从而扩展DNA结构的多样性。因此,理解DNA与非天然碱基间的相互作用对DNA纳米技术具有重要意义。本研究提出采用等离激元天线增强红外光谱技术,探究聚胸腺嘧啶DNA(poly T DNA)与三聚氰胺之间的氢键相互作用。通过1680 cm⁻¹处新出现的NH₂变形振动红外特征峰,揭示了三聚氰胺与poly T DNA胸腺嘧啶之间多重氢键的形成。该亲和反应的结合速率常数(kₑ)和解离速率常数(k₄)分别达到39.70 M⁻¹·s⁻¹和4.49 × 10⁻⁵ s⁻¹。本研究为在分子水平研究DNA纳米结构提供了有价值的红外技术手段,为DNA编程中DNA与非天然碱基的相互作用机制提供了独特的物理化学视角。

DOI: 10.1021/acs.jpclett.1c02901